bioinformatica, materiale disponibile:
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Utilizzo di tecniche bioinformatiche volte alla messa a punto di un metodo di pre-screening, in-silico, di Dicheto Acidi inibitori della trascrittasi inversa di HIV-2.
Autore: Vito Genna
Abstract: Al fine di scoprire le basi strutturali e molecolari della resistenza della Trascrittasi Inversa (RT) del virus HIV-2 ad una classe di farmaci di nostro interesse e di poter, in secondo luogo, fornire informazioni utili allo sviluppo di una nuova generazione dei suddetti, è stato condotto uno studio in silico combinando l’analisi di strutture ottenute da cristalli proteici, dati clinici correlati ai domini funzionali della Trascrittasi Inversa, grazie ad un attento data-mining, e una serie » -
Progettazione ed Implementazione di un Sistema Informativo a supporto di un Reparto di Odontoiatria
Autore: Antonio La Gamma
Abstract: L’obiettivo del presente lavoro è la progettazione di un WIS per la gestione dei pazienti di un reparto di odontoiatria, regolando, al contempo, anche le prestazioni effettuate e da effettuare su di essi. Il lavoro di analisi è stato, in particolar modo, applicato al reparto di Odontoiatria del Policlinico Universitario “Mater Domini” di Catanzaro. La tesi è articolata in cinque capitoli. Il primo capitolo tratterà degli standard e della rappresentazione e gestione di dati nel campo » -
Implementazione in .NET di un Framework per l'analisi di sistemi biologici basato sulla programmazione concorrente con vincoli
Autore: Diego Banovaz
Abstract: La costruzione di modelli di alcuni aspetti della realtà è sempre stata un tassello fondamentale del metodo di indagine scientifico. Le tecniche di modellizzazione dei giorni nostri permettono di descrivere e ragionare su aspetti sempre più complessi del mondo. In questo la matematica e l'informatica hanno un ruolo fondamentale: la prima fornisce una cornice formale entro cui costruire dei modelli, la seconda mette a disposizione potenti strumenti computazionali per l'analisi. L'aumento della » -
Un ambiente informatica per la valutazione dei geni rilevanti in un processo di valutazione di microarray dataset
Autore: Stefano Atzeni
Abstract: I microarray sono uno strumento importantissimo delle così dette nanotecnologie. Introdotto nel 1996, sono tutt’ora diventati uno strumento affidale e preciso per lo studio dell’espressione genica. L’ultimo decennio ha visto l’implementazione e la diffusione di numerosi package per l’analisi di questa tipologia di dati. Di massima, i package, possono essere classificati in tre grandi categorie. La prima categoria è orientata all’operatore medico e permette di effettuare operazioni di » -
Sperimentazione di tecniche di information retrieval e machine learning nello splice junction recognition
Autore: Emanuele Goffredo
Abstract: Il tirocinio è consistito nella sperimentazione di tecniche informatiche di Information Retrieval e di Machine Learning su un dominio biologico. Negli ultimi anni Informatica e Biologia hanno subito un'inaspettata convergenza che ha portato allo sviluppo di nuove metodologie che si avvalgono delle conoscenze informatiche per semplificare la gestione di dati in campo biologico. Difatti queste informazioni, prima dell'avvento dell'informatica diffusa su larga scala, erano difficilmente gestite » -
Costruzione di un modello farmacoforico per il recettore alpha degli estrogeni
Autore: Simone Brogi
Abstract: Un modello farmacoforico tridimensionale per il recettore alfa degli estrogeni (ER-α) è stato sviluppato usando il software CATALYST®, con la possibilità di individuare nuovi inibitori del target cellulare attraverso il virtual screening. Molecole con possibile attività antiestrogenica (24 composti), con diverse proprietà strutturali, e con valori di attività, espressi in IC50, compresi tra 0.02 e 267.4 μM per la lina cellulare MCF-7 (adenocarcinoma delle ghiandole mammarie), sono stati » -
Progetto di gestione e messa in rete di dati diagnostici in Oncologia molecolare. L’esperienza di un Centro di Sequenziamento del Dna
Autore: Elena Pitotti
Abstract: Il paradigma della Evidece-Based Medicine (EBM) sin dalla sua storica presentazione,circa 15 anni fa, ha rappresentato secondo la definizione di Sackett, l’uso scrupoloso esplicito e condiviso della migliore evidenza scientifica disponibile per l’iter decisionale clinico nell’approccio al singolo paziente. Negli anni il concetto è maturato sino all’elaborazione di un nuovo paradigma che è l’Evidence-Based Healt Care (EBHC), secondo il quale l’approccio usato per la gestione clinica del singolo » -
Analisi statistiche su banche dati di strutture di proteine
Autore: Salvatore Loguercio
Abstract: 1) Studio del motivo strutturale Poliprolina II 2) Mappe di energia conformazionale derivate mediante analisi statistiche del Protein Data Bank » -
Teoria e ricerca di patterns in biosequenze
Autore: Desir Franchin
Abstract: I metodi computazionali introdotti in questi anni hanno dato origine alla biologia molecolare computazionale, settore dell'algoritmica che studia problemi di carattere biologico, primo tra tutti la classificazione delle molecole di DNA/RNA e proteiche in insiemi detti "famiglie" » -
Studi di proteomica sulla cultivar di grano duro Simeto
Autore: Leda Occhipinti
Abstract: Lo scopo del lavoro di Tesi è stato quello di effettuare un primo screening sulla composizione proteica della cultivar di grano duro Simeto mediante l’utilizzo combinato di elettroforesi bidimensionale (2D-PAGE), spettrometria di massa (MALDI-TOF MS, HPLC-ESI MS/MS, n-ESI MS/MS) e analisi bioinformatica (server Mascot) , determinando, fra l’altro, varianti proteiche. »
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