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Sequenze Stellate nell’eucromatina del genere Drosophila

Informazioni tesi

  Autore: Angelantonio Calabrese
  Tipo: Tesi di Laurea
  Anno: 2004-05
  Università: Università degli Studi di Bari
  Facoltà: Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali
  Corso: Scienze Biologiche
  Relatore: Maria F. Berloco
  Lingua: Italiano
  Num. pagine: 90

In un recente studio è stata ipotizzata una possibile via evolutiva che in D. melanogaster ha portato alla formazione degli elementi Stellate e crystal.
In questo lavoro di tesi ho isolato e analizzato le sequenze Stellate presenti nell’eucromatina del cromosoma X in due specie del genere Sophophora sottogruppo melanogaster: D. simulans e D. sechellia.
L’indagine è stata condotta effettuando il clonaggio della sequenza Stellate dell’eucromatina del cromosoma X di D. simulans, presente in un fago isolato da una libreria genomica di D. simulans; definendo la sequenza nucleotidica e effettuando l’analisi del DNA clonato;effettuazione dell’isolamento, mediante amplificazione per PCR, di sequenze Stellate presenti nell’eucromatina del cromosoma X di D. sechellia con il suo clonaggio e determinazione della sequenza nucleotidica del DNA amplificato; e in fine effettuando l’analisi dell’attività trascrizionale dei loci isolati.
Dalle analisi effettuate ho potuto confermare le ipotesi sulla via evolutiva andando in più a determinare lo stato di conservazione e le eventuali modifiche che le distanze evolutive hanno creato con eventi di trasposizione e di amplificazione

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1 INTRODUZIONE Il materiale genetico delle cellule eucariotiche, definito da Fleming nel 1876, “cromatina”, è formato da complessi nucleoproteici, la cui struttura è determinata dall’interazione del DNA con RNA e proteine. Sequenze differenti di DNA presentano un grado di condensazione variabile durante il ciclo cellulare. Ne deriva una classificazione della cromatina in due stati differenti entrambi presenti nella cellula: eterocromatina ed eucromatina. L’ eucromatina si presenta in forma condensata in metafase e in forma decondensata in interfase. Contiene la maggior parte dei geni strutturali, a singola copia. L’eterocromatina è la porzione genomica, che rimane visibilmente condensata durante l’intero ciclo cellulare, nell’uomo rappresenta circa il 15% del genoma, nella Drosophila melanogaster circa il 30- 35%. L’eterocromatina ha una replicazione tardiva in fase S del ciclo cellulare, presenta una ridotta ricombinazione meiotica, ha un livello percentuale di trascrizione più basso rispetto all’eucromatina, e presenta un ridotto numero di geni per unità di lunghezza. L’eterocromatina corrisponde a regioni cromosomiche e talvolta a interi cromosomi. E’ situata nelle regioni pericentromeriche e telomeriche. E’ formata da sequenze di DNA altamente ripetute, principalmente rappresentate da DNA satellite e da sequenze mediamente ripetute (10-50), rappresentate principalmente dagli Elementi Trasponibili (Young 1979). Ancora oggi è poco chiaro il ruolo biologico dell’eterocromatina, anche se è risultata indispensabile nel genoma degli eucarioti.

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Parole chiave

drosophila
eucromatina
sequanza stellate
sistema crystall-stellate

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