Utilizzo di tecniche bioinformatiche volte alla messa a punto di un metodo di pre-screening, in-silico, di Dicheto Acidi inibitori della trascrittasi inversa di HIV-2.

5 1.Introduzione 1.1. Patogenesi dell’ infezione da HIV Nel 1981 l’istituto Center for Diseases Control (CDC) ha evidenziato un’insolita infezione di Penumocystis Carinii penumonia (PCP) in cinque giovani soggetti di sesso maschile, omosessuali, e provenienti da Los Angeles [1]. Successivamente furono descritti altri casi di soggetti con le stesse caratteristiche socio-comportamentali [2]. Inizialmente oltre il 90% dei casi vennero riscontrati in soggetti omosessuali e bisessuali, ed essendo così alta l’incidenza, la patologia venne definita “gay-related immunodeficiency” (GRID). A partire dal 1982 vennero riconosciuti centinaia di casi di Sindrome da Immunodeficienza Acquisita (AIDS), prevalentemente in tossicodipendenti che facevano uso di droghe somministrate per via parenterale, in soggetti sottoposti a trasfusioni di sangue, emofilici, soggetti adulti eterosessuali e nuovi nati da madre affetta da AIDS [3]. Negli stessi anni venne notato nei giovani soggetti omosessuali di sesso maschile, un considerevole aumento dell’incidenza del Sarcoma di Kaposi strettamente connesso con l’AIDS [4]. L’eziologia dell’infezione che causa l’AIDS è caratterizzata dalla grave diminuzione in numero e funzione del Linfociti T-helper che ha suggerito quindi la presenza di un agente linfotropico, causa della deplezione massiccia dei Linfociti [5]. L’agente eziologico venne quindi definito come Human T-cells Leukaemia virus (HTLV-1), primo candidato, per la ricerca della connessione tra agente virale e AIDS [6]. Un virus strettamente connesso ad esso, definito “Human T-Lymphotropic retrovirus” venne ritrovato in un linfonodo di un paziente francese ad alto rischio AIDS, successivamente definito come “Virus associato alla linfoadenopatia” (LAV). Venne inizialmente identificato come sottospecie del virus HTLV-III e solo dopo essere stato isolato al National Cancer Institute, venne denominato “AIDS associated retrovirus” (ARV) [7, 8]. Nel corso degli anni questi virus sono stati messi in stretta relazione, sono stati clonati e caratterizzati e ciò ha portato all’attuale definizione di “Human Immunodeficiency virus type 1” e “Human Immunodeficiency virus type 2” rispettivamente identificati dalle sigle: HIV-1 e HIV-2 [9]. Studi molecolari e sieroepidemiologici hanno stabilito una forte correlazione tra l’infezione da HIV e lo sviluppo dell’AIDS [9]. Le sequenze genetiche conosciute di HIV-1 sono correlate strettamente con quelle del virus SIV che provoca immunodeficienza nelle scimmie appartenenti alla specie Pan Troglodytes Troglodytes, sottospecie appartenente agli Scimpanzé [11]. Si pensa infatti che l’esplosione di questa patologia