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Interaction studies of small molecules with BC2L-C by Saturation Transfer Difference (STD) NMR

Estratto della Tesi di Saba Sanouabri

Estratto dalla tesi: Interaction studies of small molecules with BC2L-C by Saturation Transfer Difference (STD) NMR
Chapter 1 – NMR Methods 
 
5 
 
Chapter 1 
1 NMR methods  
Nuclear Magnetic Resonance (NMR) is a spectroscopy technique based on the absorption of 
electromagnetic radiation in the radiofrequency region by nuclei of the atoms. 
Nuclear Magnetic Resonance was first described and measured in molecular beams by Isidor Rabi 
in 1938 by extending the Stern–Gerlach experiment. In 1944, Rabi was awarded the Nobel Prize 
in Physics for this work. In addition to its fundamental role in physics, NMR spectroscopy is also a 
potent tool in the fields of chemistry and biology research on the structure of small organic and 
inorganic compounds and large organic molecules, including polymers and biomolecules.
7
 NMR 
spectroscopy can also be employed for studies of interactions of biomolecules with small organic 
ligands and other biological macromolecules, with no need for co-crystallization. The binding 
interface can easily be mapped, and the binding affinity can be extracted from the NMR 
observables. The principal NMR observables useful for interaction studies are described in the 
following paragraphs. 
In specific, in this thesis, solution-NMR has been utilized as a tool for the characterization of 
chemical compounds at the atomic level to determine the conformational properties at 
equilibrium and additionally for the examination of ligands - receptor interaction. Specific 
attention is focused Nuclear Overhauser effect since of its importance in both conformational and 
affinity NMR analysis. In the following chapters, the basis of NOE will be discussed since it is 
involved in NOESY experiments and STD techniques.  
 
1.1 NMR basic concepts 
The nucleus of an atom possesses four fundamental properties: mass, electric charge, magnetism, 
and spin. Although the latter two properties do not affect the overall chemical or physical 
properties of a substance, they are vital to the technique of NMR, providing an invaluable insight 
into the structure and dynamics of chemical systems. The magnitude of the spin angular 
momentum, I, associated with a nucleus is given by (1).
8
 
L=√l(l+1) h2π(l=0,1, 2,…,n−1)                                                      (1.1)   
where the associated spin quantum number I may be zero, half-integer, or integer. The value of I 
for a particular isotope is dependent on its nuclear structure and can be rationalized using the 
nuclear shell model. Nuclei with non-zero spin can be studied with NMR.

Estratto dalla tesi:

Interaction studies of small molecules with BC2L-C by Saturation Transfer Difference (STD) NMR

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Informazioni tesi

  Autore: Saba Sanouabri
  Tipo: Tesi di Master
Master in Industrial Chemistry
Anno: 2021
Docente/Relatore: Francesca Vasile
Istituito da: Università degli Studi di Milano
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 83

FAQ

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Parole chiave

nmr technique
saturation transfer difference (std)
bc2l-c
urkholderia cenocepacia

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