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Studying the epidemiology of Xylella fastidiosa ssp. in different host plants through molecular tools (real time PCR, LAMP)

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Anteprima della tesi: Studying the epidemiology of Xylella fastidiosa ssp. in different host plants through molecular tools (real time PCR, LAMP), Pagina 2
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X. fastidiosa host plants and molecular plant-bacterium interactions
X. fastidiosa has numerous host plants including monocots and dicotyledons. It 
is possible to consult the complete list of host plants registered on the official 
EFSA website, which periodically updates the list based on the European terri-
tories. The last update of the host plants is shown in Annex 1 
(https://www.efsa.europa.eu/en/efsajournal/pub/5408). To define a plant as X. 
fastidiosa host it’s necessary that natural or artificial bacteria inoculum could 
replicate, spread and migrate along the entire growing plant causing in a wide 
and variable time range, different kinds of symptoms, commonly unified as 
chlorotic one that can be easily observed from the margins, tips or mid-veins of 
a leaf, and more difficulty from the main stem because of the larger diameter. 
It has been evaluated the role of calcium on X. fastidiosa spread into the plant 
(test in vivo) and into the media plate (test in vitro); it would seem that X. fas-
tidiosa induces calcium-related genes in the plant cell and that calcium signals 
interact with the specific receptors onto bacterium cell surface permitting more 
bacteria replication that results in the biofilm composition and occlusion of the 
vascular tissue. X. fastidiosa lack type III secretion system (Dow and Daniels, 
2000), but it showed operons involved into components production of the type 
I, II, IV and V secretion systems (Simpson et al., 2000; Van Sluys et al., 2003). 
More in detail, type I secretion system represented a general secretory path-
way with many functions, including multidrug resistance efflux and different 
proteases, hydrolases and toxins secretion (Delepelaire, 2004).
Type II secretion system (T2SS) is composed of 12 proteins really closely related 
to those in Xanthomonas campestris pv. campestris and X. oryzae pv. oryzae 
(Jha et al., 2005). T2SS composition showed three different sections as well the 
first outer membrane pore, the second inner membrane complex and the third 
pseudopilin complex (Sandkvist, 2001). Type V secretion system belong to a 
family of autotransporter proteins without request of energy input with an au-
tonomous transport out of the cell (van Ulsen et al., 2014). Among T5SS, six en-
coding AT-1 autotransporter genes have been found in X. fastidiosa: the most 
relevant was XatA (Matsumoto et al., 2012). Currently, researches confirmed 
absence of type IV secretion system in X. fastidiosa.

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Informazioni tesi

  Autore: Matteo Marangi
  Tipo: Laurea II ciclo (magistrale o specialistica)
  Anno: 2018-19
  Università: Università degli Studi di Torino
  Facoltà: Agraria
  Corso: Biotecnologie agrarie
  Relatore: Davide Spadaro
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 72

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Parole chiave

real time-pcr
diagnosis
dna-extraction
epidemiology
xylella fastidiosa
plant health

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