rna, materiale disponibile:

  • Cellule Staminali Neurali: studio sperimentale utilizzando diversi modelli comparativi

    Autore: Michela Cosentino

    Abstract: Il sistema nervoso centrale (SNC) è caratterizzato da una grande complessità strutturale e dalla stretta associazione di tutte le popolazioni cellulari che ne fanno parte, ovvero neuroni e cellule gliali. Queste ultime rappresentano il 90% dei tipi cellulari presenti e ricoprono vari ruoli implicati nelle attività cerebrali sia in condizioni fisiologiche che patologiche. Appare chiaro oggi come tutti i tipi cellulari del SNC derivino da un precursore comune. I ventricoli laterali sono, »

  • Molecular Evolution of Human Cancer Genes MDS2 and TCL6

    Autore: Alessandro Riccombeni

    Abstract: Our lab recently identified systemic properties of human cancer genes when compared to the rest of human genes. These results were the starting point of an evolutionary study to identify the origin of cancer genes: for this purpose, several model organisms were used to assign orthology. Our analysis revealed that cancer genes tended to appear in evolution earlier than the rest of human genes. Only two cancer genes had no orthologs besides primates, implying a recent appearance: MDS2 and »

  • Un ambiente informatica per la valutazione dei geni rilevanti in un processo di valutazione di microarray dataset

    Autore: Stefano Atzeni

    Abstract: I microarray sono uno strumento importantissimo delle così dette nanotecnologie. Introdotto nel 1996, sono tutt’ora diventati uno strumento affidale e preciso per lo studio dell’espressione genica. L’ultimo decennio ha visto l’implementazione e la diffusione di numerosi package per l’analisi di questa tipologia di dati. Di massima, i package, possono essere classificati in tre grandi categorie. La prima categoria è orientata all’operatore medico e permette di effettuare operazioni di »

  • Studio e sviluppo di metodi robusti per la validazione automatica di miRNA

    Autore: Claudio Loconsole

    Abstract: La vita di tutte le cellule, animali e vegetali, è legata in modo indissolubile alle proteine. Le proteine svolgono, infatti, un numero notevole di funzioni per gli esseri viventi, tra le quali, funzione energetica, strutturale, immunitaria, di trasporto (di ossigeno, metalli, lipidi, di membrana), di identificazione dell'identità genetica, ormonale, enzimatica e contrattile. Per il corretto svolgimento di queste funzioni all'interno della cellula, però, è necessario che le proteine siano »

  • Modelli markoviani nascosti e grammatiche stocastiche context free

    Autore: Chiara Modotti

    Abstract: Questa tesi si occupa di due importanti categorie di modelli stocastici: i modelli markoviani nascosti, che sono un caso particolare dei modelli state space, e le grammatiche stocastiche context-free. L’obiettivo `e studiare la struttura di tali modelli, sottolineando analogie e differenze tra di essi. »

  • Selective Delivery of Quinone Methide Precursor QMP by Peptide Nucleic Acids PNAs

    Autore: Alessandro Livieri

    Abstract: The aim of this work is the synthesis of a DNA alkylating linked to a recognition agent. This component helps to prevent undesirable reactions of substrates and direct responsiveness to a specific target. This target is the mRNA of human telomerase. The mRNA of telomerase was chosen because telomerase activity was detected in many tumor cells, and it would seem a reasonable explanation of their immortalization and their resistance. The recognition agent used is the PNA (peptidic nucleic acid) »

  • Studi bioinformatici per la individuazione di regioni di interesse farmacologico della emoagglutinina influenzale

    Autore: Daniela Gigliotti

    Abstract: • AIM: The aim of this work consists on the identification of conserved regions of hemagglutinin of all the subtypes of influenza virus to be used as a rational basis for the design of drugs which are able to interfere with viral infection. • METHODS: Through the use of protein data banks it was possible to obtain consensus sequences of hemagglutinin of various strain subtypes. The alignment of the latter sequences was done to achieve only one consensus sequence for every subtype. Molecular »

  • Costruzione di un vettore per la soppressione del gene ARH responsbile dell'ipercolesterolemia autosomica recessiva (ARH)

    Autore: Malika Brandi

    Abstract: Il pSUPER è un nuovo tipo vettore sviluppato nell’ambito della ricerca genetica sui mammiferi. Il nostro lavoro si è incentrato sull’utilizzo di questo vettore nell’ambito di una rara malattia genetica: l’Ipercolesterolemia Autosomica Recessiva (ARH). La scoperta di questa nuova forma di ipercolesterolemia risale ai primi anni ’70 con il lavoro di Khachadurian. Dopo anni di studi è stata individuata nel 2001 la proteina difettosa responsabile di questa patologia chiamata appunto ARH. Si »

  • Prediction of signal recognition particle RNA genes

    Autore: Marco Regalia

    Abstract: BACKGROUND: The signal recognition particle (SRP) is a cytoplasmic ribonucleoprotein complex responsible for the cotranslational targeting of secretory and membrane proteins to the endoplasmic reticulum in eukaryotes or to the plasma membrane in prokaryotes. SRP RNA is a noncoding RNA component of SRP present in all living cells so far examined. We describe a method for prediction of genes that encode SRP RNA. A heuristic search for the strongly conserved helix 8 motif is combined with »

  • Struttura secondaria e importanza filogenetica della subunità ribosomale mitocondriale 12S nei Collemboli (Insecta)

    Autore: Angela Martino

    Abstract: Approccio molecolare alla filogenesi di 14 famiglie di Collemboli: analisi della sequenza del dominio III del gene mitocondriale dell'rRNA 12S, che codifica per la subunità ribosomale piccola (SSU). Questo frammento di DNA è stato amplificato mediante PCR e sequenziato; in seguito sono state analizzate le strutture secondarie, le porzioni altamente conservate e la composizione a livello di basi nucleotidiche delle sequenze complete e di stems e loops. »