Glicolisi, paragrafi appunti disponibili

Le reazioni della glicolisi: piruvato chinasi: seconda formazione di ATPNella reazione 10 della glicolisi, la reazione finale, la piruvato chinasi (PK) accoppia l'energia libera di idrolisi del PEP alla sintesi di ATP, formando piruvato. La reazione della PK avviene nel modo seguente:L'atomo di ossigeno del gruppo fosforico β dell'ADP attacca nucleofilicamente l'atomo di fosforo del PEP, producendo enol piruvato e ATP. In questa reazione viene conservata l'energia libera di idrolisi del PEP;L'enol piruvato si converte in piruvato. Questa tautomerizzazione enol-chetonica è...

Le reazioni della glicolisi: enolasi -la seconda formazione di un intermedio ad alta energiaNella reazione 9 della glicolisi, il 2PG viene deidratato a fosfoenolpiruvato (PEP) ad opera dell'enolasi. Questo enzima forma un complesso con un catione bivalente come Mg2+. La deidratazione (eliminazione di una molecola di acqua) catalizzata dall'enolasi può avvenire principalmente in tre modi: (1) si può staccare prima l'ossidrile da gruppo C(3)-OH, generando un carbocatione sul C(3); (2) si può staccare per prima cosa il protone dal C(2), generando un carboanione; oppure (3) la reazione...

Le reazioni della glicolisi: fosfoglicerato mutasiNella reazione 8 della glicolisi, il 3PG viene convertito in 2-fosfoglicerato (2PG) ad opera della fosfoglicerato mutasi (PGM). Una mutasi catalizza il trasferimento di un gruppo funzionale da una posizione a un'altra nella stessa molecola. Questa reazione è praticamente una preparazione necessaria per la reazione successiva della glicolisi, in cui viene generato un composto fosforilato “ad alta energia”, da usare per la sintesi dell'ATP. Il sito attivo in questo caso contiene un residuo di fosfo His e la reazione procede nel seguente...

Le reazioni della glicolisi: gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi - la prima formazione di un intermedio ad alta energiaLa reazione 6 della glicolisi coinvolge l'ossidazione e la fosforilazione della GAP da parte del NAD+ e del Pi, catalizzate dalla gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi (GAPDH). In questa reazione, l'ossidazione dell'aldeide, una reazione esoergonica, guida la sintesi dell'acil fosfato 1,3-bifosfoglicerato (1,3-BPG). Ricordiamo che gli acil fosfati sono composti con un alto potenziale di trasferimento del gruppo fosforico e che anche in questa reazione abbiamo la...

Le reazioni della glicolisi: Trioso fosfato isomerasiSoltanto, uno dei prodotti della reazione di scissione aldolica, la GAP, continua lungo la via glicolitica. Il DHAP e la GAP sono isomeri chetosio-aldosio, proprio come il G6P e l'F6P. È possibile quindi interconvertire il DHAP e la GAP mediante la formazione di un intermedio enediolato, in analogia con la reazione della fosfoglucomutasi (un enzima utilizzato successivamente). La triosiofosfato isomerasi (TIM) catalizza questo processo nella reazione 5 della glicolisi, la reazione finale della Fase I. La curva di dipendenza...

Le reazioni della glicolisi: fosfofrutto chinasi - la seconda utilizzazione dell'ATPNella reazione 3 della glicolisi la fosfofrutto chinasi (PFK) fosforila l'F6P per formare il fruttosio-1,6-bisfosfato (FBP). Questa reazione è simile a quella dell'esochinasi. La PFK catalizza l'attacco nucleofilo da parte del gruppo C(1)-OH dell'F6P sull'atomo di fosforo elettrofilo del complesso ATP-Mg2+. La PFK ha una funzione prioritaria nel controllo della glicolisi in quanto catalizza una delle reazioni che determinano la velocità complessiva della via metabolica. In molti organismi l'attività...

Le reazioni della glicolisi: fosfoglucosio isomerasiLa reazione 2 della glicolisi è la conversione del G6P in fruttosio-6-fosfato (F6P) ad opera della fosfoglucosio isomerasi (PGI). Questa è l'isomerizzazione di un aldosio in un chetosio. Poiché il G6P e l'F6P sono principalmente presenti nella forma ciclica la reazione richiede l'apertura dell'anello, seguita dall'isomerizzazione e dalla successiva richiusura dell'anello. La velocità catalitica in funzione del pH ha un andamento a campana con valori caratteristici di 6,7 e 9,3, che suggeriscono la partecipazione della catalisi di...

Le reazioni della glicolisi: esochinasi - la prima utilizzazione dell'ATPLa reazione 1 della glicolisi è il trasferimento di un gruppo fosforico dell'ATP al glucosio per formare glucosio-6-fosfato (G6P) in una reazione catalizzata dall'esochinasi.Una chinasi è un enzima che trasferisce gruppi fosforici tra l'ATP e un metabolita. L'esochinasi è un enzima contenuto in tutte le cellule che catalizza la fosforilazione di esosi come il glucosio, il fruttosio e il mannosio. Il secondo substrato dell'esochinasi, invece, è un complesso ATP-Mg2+. Infatti, l'ATP non impiegato in un...