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Studying the epidemiology of Xylella fastidiosa ssp. in different host plants through molecular tools (real time PCR, LAMP)

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This event was not relevable in not X-fastidiosa infected grapevine. Further, 
catechol, caffeic acid and resveratrol phenolic molecules were in vitro capable 
as anti-X. fastidiosa proliferation. During the latest stage (6
th
 month of PD de-
velopment), the concentration of phenolic compounds rapidly decreased in 
both X. fastidiosa-infected and not infected grapevine plants with a tight asso-
ciation of PD-symptoms development in X. fastidiosa-infected grapevine. These 
considerations bring to relate phenolic production in grapevine to an early 
plant response to X. fastidiosa, limiting system infections although not enough 
successfull X. fastidiosa inhibition during the plant growth. Grapevine cultivars, 
as ‘Chardonnay’ or ‘Crimson Seedless’, can be considered as X. fastidiosa fastid-
iosa susceptible host plant showing PD symptoms earlier than others grapevine 
cvs. that, instead, biosynthesized higher quantity (g/mL) of phenolic com-
pounds resulting in resistant phenotype  (Wallis and Chen, 2012). Other molec-
ular evidence permitted to discriminate the aggressivity of pathogen strains as 
9a5c and Temecula1 from the others; indeed the two X. fastidiosa strains 
showed frameshift mutation on polygalacturonase enzyme sequence that make 
the bacteria less infective (Simpson et al., 2000; Van Sluys et al., 2003; Sun et 
al., 2011; Roper et al., 2007). Transmission electron microscopy (TEM) revealed 
the presence of outer membrane vesicles (OMV) cargo proteins of which one of 
them as LesA was localised through immunoblot analysis in the X. fastidiosa 
fastidiosa secretome and OMV proteome. Infections of X. fastidiosa fastidiosa 
in grapevine plants showed PD symptoms with the major presence of LesA pro-
tein in the marginal portion of infected leaves was detected. Thus, it existed a 
tight correlation between PD macroscopic leaf scorch with X. fastidiosa fastidi-
osa-LesA protein biosynthesis. OMV proteins resulted able to transport several 
and different bacterial proteins as LesA into the host cell. Amongst the outer 
membrane proteins, X. fastidiosa fastidiosa is characterised to have four of 
them as MopB as the major OMP. Considering the outer bacterial membrane, 
the elongation factor Tu (EF-Tu) has been classified as pathogen associated mo-
lecular patterns (PAMP) in many Gram-negative bacteria showing its abundan-
cy in X. fastidiosa fastidiosa outer membrane fraction. Although EF-Tu showed 
outer membrane localization, it was not relevable in X. fastidiosa fastidiosa se-
cretome or as part of the OMV cargo. The scansion and transmission electron 
microscopy (SEM and TEM) showed X. fastidiosa fastidiosa as productive cell 
with ability to aggregate several and variable cells in a dense secreted material 
made of extracellular polysaccharides (EPS) and proteins that showed not tight-
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Studying the epidemiology of Xylella fastidiosa ssp. in different host plants through molecular tools (real time PCR, LAMP)

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Informazioni tesi

  Autore: Matteo Marangi
  Tipo: Laurea II ciclo (magistrale o specialistica)
  Anno: 2018-19
  Università: Università degli Studi di Torino
  Facoltà: Agraria
  Corso: Biotecnologie agrarie
  Relatore: Davide Spadaro
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 72

FAQ

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Parole chiave

real time-pcr
diagnosis
dna-extraction
epidemiology
xylella fastidiosa
plant health

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