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New and innovative strategies in order to overcome antibiotic resistance: a focus on phage therapy and fecal microbiota transplantation

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Indice della tesi: New and innovative strategies in order to overcome antibiotic resistance: a focus on phage therapy and fecal microbiota transplantation, Pagina 1
1 
 
Sommario 
List of abbreviations: ....................................................................................................... 3 
Abstract: ........................................................................................................................... 6 
Chapter 1: Microbiology of antibiotic resistance ........................................................... 7 
Most common mechanisms of Resistance of Bacteria ............................................. 7 
Genetic basis of Antimicrobial resistance ................................................................. 7 
Mutational resistance ............................................................................................. 7 
HGT – horizontal gene transfer ............................................................................ 8 
Hypermutable phenotypes ..................................................................................... 9 
Principal mechanisms of antimicrobial resistance ................................................ 10 
Modification of the antibiotic molecule .............................................................. 10 
Destruction of the antibiotic molecule ................................................................ 12 
Decreased Antibiotic Penetration and Activation Efflux Pumps ..................... 15 
Changes in target sites .......................................................................................... 18 
Biofilm production ................................................................................................ 23 
Chapter 2: approaches to AMR in Europe and in Italy ............................................... 25 
WHO .......................................................................................................................... 26 
ECDC ......................................................................................................................... 27 
EARSS ........................................................................................................................ 28 
Surveillance system of AMR: ................................................................................... 31 
AR-ISS, 2019 Protocol .............................................................................................. 32 
PNCAR (PNCAR, 2019) ........................................................................................... 36 
CHAPTER 3: Bacteriophage therapy as a possible solution to overcome AMR ........ 37 
Bacteriophage description and morphology ........................................................... 37 
Historical background of Phage therapy  ............................................................... 41 
Bacteriophage therapy in clinical setting ................................................................ 48 
Examples in clinical applications of phage therapy ............................................... 60

2 
1) Phagoburn trial : how a non-fully successful project can be used as a 
golden standard in the clinical practice for phage therapy .............................. 60 
2) First use of engineered bacteriophage: 15-years old cystic fibrosis patient 
with a disseminated Mycobacterium abscessus infection treated with three-
phage cocktails following bilateral lung transplantation .................................. 65 
3) Non-active antibiotic and bacteriophage synergism to treat successfully 
recurrent urinary tract infection cause by extensively drug resistant Klebsiella 
pneumoniae  ........................................................................................................... 67 
4) Salvage Bacteriophage therapy for a chronic MRSA prosthetic joint 
infection  ................................................................................................................. 68 
CHAPTER 4: Fecal microbiota transplantation .......................................................... 72 
Gut microbiota .......................................................................................................... 72 
Techniques for studying gut microbiome: .............................................................. 74 
Effects of gut microbiota in infections: ................................................................... 75 
Fecal Microbiota transplantation ............................................................................ 76 
Preparation of faecal material: ................................................................................ 77 
Donor Selection: ..................................................................................................... 79 
Examples of clinical applications of FMT .............................................................. 81 
Conclusion ...................................................................................................................... 86 
Bibliografia .................................................................................................................... 88

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New and innovative strategies in order to overcome antibiotic resistance: a focus on phage therapy and fecal microbiota transplantation

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Informazioni tesi

  Autore: Gabriella Marsoni
  Tipo: Laurea magistrale a ciclo unico
  Anno: 2019-20
  Università: Università degli Studi di Roma Tor Vergata
  Facoltà: Farmacia
  Corso: Farmacia
  Relatore: Francesca Ceccherini Silberstein
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 95

FAQ

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Parole chiave

microbiota
bacteriophage
phage therapy
antibiotic resistance
fmt
fecal microbiota transplantation

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