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Prediction of signal recognition particle RNA genes

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- 10 - 2.3 Functions of RNA molecules A number of RNAs that do not function as mRNAs, transfer RNAs (tRNAs), or ribosomal RNAs have been discovered. In the literature, the non-mRNAs have been referred in many different ways: the term small RNAs (sRNAs) has been more common in bacteria, whereas the term noncoding RNAs (ncRNAs) has been preferred in eukaryotes. ncRNAs vary in size from 21 to 25 nt for the big family of microRNAs (miRNAs) that modulate development in C. elegans, Drosophila, and mammals [2], up to 200 nt for sRNAs commonly found as translational regulators in bacterial cells [3] and to >10,000 nt for RNAs implicated in gene silencing in higher eukaryotes [4]. The functions described for ncRNAs so far are extremely varied. The mechanisms of action for the characterized ncRNAs can be grouped into numerous general categories. There are ncRNAs where base pairing with another RNA or DNA molecule is central to function. The snoRNAs that direct RNA modification and the bacterial RNAs that modulate translation by forming base pairs with specific target mRNAs are examples of this category. Some ncRNAs resemble the structures of other nucleic acids: the 6S RNA structure is reminiscent of an open bacterial promoter and the tmRNA has characteristics of both tRNAs and mRNAs. Other ncRNAs, such as the RNase P RNA, have catalytic functions. Most ncRNAs are associated with proteins that augment their functions; however, some ncRNAs, such as the snRNAs and the SRP RNA, serve key structural roles in RNA-protein complexes. Several ncRNAs fit into more than one mechanistic category. The mechanisms of action for a number of ncRNAs are unknown, and it is probable that some ncRNAs act in ways that have not yet been established.
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Prediction of signal recognition particle RNA genes

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Informazioni tesi

  Autore: Marco Regalia
  Tipo: Tesi di Dottorato
Dottorato in Biologia Cellulare e Molecolare
Anno: 2002
Docente/Relatore: Graziano Pesole
Correlatore: ToreSamuelsson
Istituito da: Università degli Studi di Milano
Dipartimento: Biologia
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 88

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bioinformatics
dna
rna
rnomics
genomics
molecular biology
informatics
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human genome

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