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Analisi statistiche su banche dati di strutture di proteine

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11 Il numero delle risorse secondarie aumenta di anno in anno: un elenco aggiornato è reperibile alla pagina http://www.pdb.org/pdb/links.html . 1.4 Sviluppi recenti La biologia strutturale è un settore in rapida espansione che impone sfide nell’ambito dell’acquisizione, gestione e distribuzione dei dati di struttura. In questo contesto, la sfida principale è senza dubbio rappresentata dal concetto di genomica strutturale. Con questo termine si indica lo sviluppo e l’utilizzazione di determinazioni strutturali high throughput per diversi ed importanti scopi tra cui: la completa esplorazione dello spazio di folding delle proteine, con conseguente perfezionamento delle tecniche di homology modeling; la determinazione del maggior numero possibile di strutture di proteine in relazione ad un dato genoma; l’approfondimento, su scala molecolare, delle conoscenze riguardanti patologie specifiche e/o particolari percorsi biochimici implicati in patologie. Benchè gli obiettivi specifici possano essere differenti, le modalità di realizzazione dei vari progetti sono essenzialmente le stesse; la più diretta implicazione di questo fenomeno è un aumento esponenziale nella quantità di informazioni strutturali disponibili. A partire dal 1999 il numero di strutture depositate nel PDB ha seguito mediamente il ritmo di 50 entries per settimana. Attualmente nell’archivio sono 1974 1977 1980 1983 1986 1989 1992 1995 1998 2001 2004 0 5000 10000 15000 20000 25000 STRUTTURE DISPONIBILI NEL PROTEIN DATA BANK (PDB) (aggiornamento Dic2003) n . d i s t r u t t u r e Anno strutture nuove depositate nell'arco dell'anno strutture complessive Figura 2 - Numero totale di strutture depositate e numero di strutture depositate per anno nel PDB.

Anteprima della Tesi di Salvatore Loguercio

Anteprima della tesi: Analisi statistiche su banche dati di strutture di proteine, Pagina 6

Tesi di Laurea

Facoltà: Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali

Autore: Salvatore Loguercio Contatta »

Composta da 94 pagine.

 

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