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Sintesi e caratterizzazione di nuovi inibitori della trombina

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 6 
La catena A, caratterizzata da numerosi turn e un breve segmento elicoidale nella zona 
C-terminale, si trova in una fenditura della catena B. La risoluzione strutturale dell�α - 
trombina umana, mediante diffrazione dei raggi X � caratterizzata dalla presenza sulla 
superficie di diverse �fenditure� e �asperit�� probabilmente responsabili della grossa 
variet� di funzioni biologiche sviluppate dall�enzima. Queste �fenditure� o �asperit�� 
infatti sembrano comportarsi come �chiavi� o �serrature� nell�interazione della 
trombina con substrati e/o inbitori. 
In Fig. 1.1 � rappresentata la superficie dell�α -trombina umana dove sono indicati i 
principali siti di interazione. Il sito catalitico, contenente la triade catalitica (Ser 
195
, 
His 
57 
 e Asp 
102
), � situato all�interfaccia tra i due domini β-barrel. Esso � identico, nei 
limiti dell�errore sperimentale, in tutte le strutture cristalline note fino ad oggi, ed 
inoltre mostra la geometria comune a tutte le serino proteasi. Il sito attivo � delimitato 
da un�estesa regione idrofobica, contenente il subsito S
2
 e il cosiddetto �aryl bindig 
site� e dal subsito di specificit� S
1
 [12] L� �ingresso� al sito di specificit� � 
caratterizzato dalla presenza di vari residui carichi negativamente. Tra questi � 
importante ricordare Glu
122
 e Asp
189
 che non sono direttamente coinvolti nella 
formazione di ponti salini intramolecolari ma che rivestono un ruolo importante nel 
riconoscimento di substrati e inibitori. Lontano dal sito catalitico sono situate due 
regioni ad alta densit� di carica positiva. Una di essa, conosciuta come �exosito di 
riconoscimento del fibrinogeno�, si trova approssimativamente intorno al segmento 
65-76. L�exosito di riconoscimento del fibrinogeno � coinvolto nel riconoscimento del 
fibrinogeno, della trombomodulina e dell�inibitore naturale irudina. Tutte queste 
molecole presentano una sequenza peptidica ricca di residui carichi negativamente. 
Un�altra regione a forte densit� di carica positiva � probabilmente coinvolta nel 
legame con l�eparina.  

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Sintesi e caratterizzazione di nuovi inibitori della trombina

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Informazioni tesi

  Autore: Gian Felice De Nicola
  Tipo: Tesi di Laurea
  Anno: 2001-02
  Università: Università degli Studi di Napoli
  Facoltà: Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali
  Corso: Chimica
  Relatore: Vincenzo Pavone
  Lingua: Italiano
  Num. pagine: 72

FAQ

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hplc
nmr
porfirine
sintesi organica
sintesi peptidica
tetrafenilporfirine
trombina
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