Skip to content

Riconoscimento di sequenze di amminoacidi tramite HMM

Informazioni tesi

  Autore: Guido Bartoli
  Tipo: Laurea liv.I
  Anno: 2003-04
  Università: Università degli Studi di Siena
  Facoltà: Ingegneria
  Corso: Ingegneria dell'informazione
  Relatore: Marco Maggini
  Lingua: Italiano
  Num. pagine: 31

Questa tesi presenta un metodo per riconoscere la presenza di ponti di cisteine all'interno di proteine tramite Modelli di Markov Nascosti.

CONSULTA INTEGRALMENTE QUESTA TESI

La consultazione è esclusivamente in formato digitale .PDF

Acquista
Mostra/Nascondi contenuto.
1Introduzione La bioinformatica ha guadagnato al giorno d’oggi grande popolarita`invari settori, sia nell’ambito scientifico, sia nella nostra quotidianita`, grazie soprat- tutto ad eventi ampiamente pubblicizzati, come la mappatura del genoma umano o la clonazione degli animali; inoltre, in virtu`deipi`u recenti sviluppi tecnologici, le capacita` di calcolo dei moderni elaboratori sono aumentate in maniera esponenziale e molti progetti che non potevano nemmeno essere affrontati con i metodi tradizionali, possono ora essere risolti o almeno sem- plificati utilizzando software e hardware dedicati. In un progetto come quello del genoma umano, ad esempio, un ruolo chiave e` stato svolto dai computer multiprocessore e dai clusters, affiancati da sofisticati sistemi di archiviazione di massa. Fra le varie applicazioni della bioinformatica, esiste anche quella relati- vamente recente dell’analisi di sequenze di aminoacidi, e piu` in generale di classi di proteine. In questo contesto, si inserisce un progetto ministeriale curato da un gruppo di biologi ed informatici di Firenze e dal dott. Trentin per conto dell’Universit ` a degli Studi di Siena. L’obiettivo principale di questo progetto e` quello di realizzare un sistema che, una volta addestrato su opportuni esempi gia` classificati, riesca a preve- dere la formazione di ponti fra coppie di cisteine all’interno di una sequenza: cio` puo` contribuire in maniera significativa a valutare la struttura secondaria della proteina, ed indirettamente anche quella terziaria (spaziale). Da un punto di vista biologico, analizzando la presenza di questi legami, e` possi- bile anche dedurre se l’RNA che verra` prodotto potra` dare origine a cellule anomale, come ad esempio quelle cancerogene. Il progetto parte dal presupposto che in natura esista una qualche “re- gola” che determina la formazione di legami in base agli aminoacidi presenti nelle proteine; regola che non sembra pero` essere derivabile con metodi logici, ma solo interpretabile su base probabilistica. Per questo motivo si utilizza una collezione di proteine nella quale biologi specialisti hanno individuato sperimentalmente i legami della cisteina: basandosi sulla maggior parte di questi esempi (training set, circa 96% del totale nel nostro caso), il sistema proposto tenta di apprendere, con un approccio tipico dell’Intelligenza Arti- ficiale,ci`o che mette in relazione le strutture delle proteine alla formazione dei ponti di cisteina; i parametri di valutazione acquisiti vengono poi appli- cati ai rimanenti esempi (test set) per verificarne l’efficienza confrontando le sequenze riconosciute con quelle note del test set stesso. In sintesi, si e` cercato di valutare le prestazioni di un riconoscitore basato su HMM applicandolo ad un problema di bioinformatica fino ad ora affrontato con altri metodi.

CONSULTA INTEGRALMENTE QUESTA TESI

La consultazione è esclusivamente in formato digitale .PDF

Acquista

FAQ

Per consultare la tesi è necessario essere registrati e acquistare la consultazione integrale del file, al costo di 29,89€.
Il pagamento può essere effettuato tramite carta di credito/carta prepagata, PayPal, bonifico bancario, bollettino postale.
Confermato il pagamento si potrà consultare i file esclusivamente in formato .PDF accedendo alla propria Home Personale. Si potrà quindi procedere a salvare o stampare il file.
Maggiori informazioni
Ingiustamente snobbata durante le ricerche bibliografiche, una tesi di laurea si rivela decisamente utile:
  • perché affronta un singolo argomento in modo sintetico e specifico come altri testi non fanno;
  • perché è un lavoro originale che si basa su una ricerca bibliografica accurata;
  • perché, a differenza di altri materiali che puoi reperire online, una tesi di laurea è stata verificata da un docente universitario e dalla commissione in sede d'esame. La nostra redazione inoltre controlla prima della pubblicazione la completezza dei materiali e, dal 2009, anche l'originalità della tesi attraverso il software antiplagio Compilatio.net.
  • L'utilizzo della consultazione integrale della tesi da parte dell'Utente che ne acquista il diritto è da considerarsi esclusivamente privato.
  • Nel caso in cui l'Utente volesse pubblicare o citare una tesi presente nel database del sito www.tesionline.it deve ottenere autorizzazione scritta dall'Autore della tesi stessa, il quale è unico detentore dei diritti.
  • L'Utente è l'unico ed esclusivo responsabile del materiale di cui acquista il diritto alla consultazione. Si impegna a non divulgare a mezzo stampa, editoria in genere, televisione, radio, Internet e/o qualsiasi altro mezzo divulgativo esistente o che venisse inventato, il contenuto della tesi che consulta o stralci della medesima. Verrà perseguito legalmente nel caso di riproduzione totale e/o parziale su qualsiasi mezzo e/o su qualsiasi supporto, nel caso di divulgazione nonché nel caso di ricavo economico derivante dallo sfruttamento del diritto acquisito.
  • L'Utente è a conoscenza che l'importo da lui pagato per la consultazione integrale della tesi prescelta è ripartito, a partire dalla seconda consultazione assoluta nell'anno in corso, al 50% tra l'Autore/i della tesi e Tesionline Srl, la società titolare del sito www.tesionline.it.
L'obiettivo di Tesionline è quello di rendere accessibile a una platea il più possibile vasta il patrimonio di cultura e conoscenza contenuto nelle tesi.
Per raggiungerlo, è fondamentale superare la barriera rappresentata dalla lingua. Ecco perché cerchiamo persone disponibili ad effettuare la traduzione delle tesi pubblicate nel nostro sito.
Scopri come funziona

DUBBI? Contattaci

Contatta la redazione a
[email protected]

Ci trovi su Skype (redazione_tesi)
dalle 9:00 alle 13:00

Oppure vieni a trovarci su

Parole chiave


Non hai trovato quello che cercavi?


Abbiamo più di 45.000 Tesi di Laurea: cerca nel nostro database

Oppure consulta la sezione dedicata ad appunti universitari selezionati e pubblicati dalla nostra redazione

Ottimizza la tua ricerca:

  • individua con precisione le parole chiave specifiche della tua ricerca
  • elimina i termini non significativi (aggettivi, articoli, avverbi...)
  • se non hai risultati amplia la ricerca con termini via via più generici (ad esempio da "anziano oncologico" a "paziente oncologico")
  • utilizza la ricerca avanzata
  • utilizza gli operatori booleani (and, or, "")

Idee per la tesi?

Scopri le migliori tesi scelte da noi sugli argomenti recenti


Come si scrive una tesi di laurea?


A quale cattedra chiedere la tesi? Quale sarà il docente più disponibile? Quale l'argomento più interessante per me? ...e quale quello più interessante per il mondo del lavoro?

Scarica gratuitamente la nostra guida "Come si scrive una tesi di laurea" e iscriviti alla newsletter per ricevere consigli e materiale utile.


La tesi l'ho già scritta,
ora cosa ne faccio?


La tua tesi ti ha aiutato ad ottenere quel sudato titolo di studio, ma può darti molto di più: ti differenzia dai tuoi colleghi universitari, mostra i tuoi interessi ed è un lavoro di ricerca unico, che può essere utile anche ad altri.

Il nostro consiglio è di non sprecare tutto questo lavoro:

È ora di pubblicare la tesi