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Analisi comparativa dei geni del ciclo cellulare in A. Thaliana e S. Cerevisiae

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5 informazioni che di avere la possibilità di analizzare grandi quantità di dati in tempi più che ragionevoli utilizzando strumenti di analisi con solide basi razionali. 1.2. Banche dati biologiche Nel 1982 l’European Molecular Biology Laboratory (EMBL) istituì la prima base di dati di sequenze nucleotidiche, l’EMBL nucleotide sequence database, cui seguirono nel 1983 il database americano GenBank e nell’ anno successivo il database giapponese DNA DataBank of Japan (DDBJ). In seguito i tre centri autori dei tre database, attraverso un accordo internazionale, INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration), decisero di condividere le proprie informazioni al fine di allineare i contenuti delle tre basi di dati. Contemporaneamente alla nascita di database contenenti informazioni di sequenza, i Brookhaven National Laboratories fondarono nel 1971 il Protein Data Bank (PDB), un archivio per il mantenimento e la fruizione delle strutture tridimensionali delle macromolecole biologiche, ottenute attraverso cristallografia a raggi X e NMR. Dopo molti anni a tale progetto americano ne è seguito uno europeo presso EBI (European Bioinformatics Istitute). Questo progetto è l’MSDSM (Macromolecular Structure Group Search Database) che è servito per l’acquisizione e il mantenimento di dati riguardanti alle strutture di macromolecole biologiche. Tali database sono detti per motivi storici e pratici database primari, ossia database che annoverano le sequenze rese disponibili dalla comunità scientifica e pochi altri dati che riguardano autori, dati, specie e descrizioni. A tali banche dati si aggiungono i database secondari, in cui l’informazione contenuta rappresenta una riorganizzazione dell’informazione presente nei database primari. Oltre a ciò esistono i database specializzati i quali riorganizzano secondo specifici criteri una
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Informazioni tesi

  Autore: Mauro Calicchio
  Tipo: Laurea liv.II (specialistica)
  Anno: 2015-16
  Università: Università degli Studi di Napoli - Federico II
  Facoltà: Scienze biologiche
  Corso: Scienze biologiche
  Relatore: Francesco Aniello
  Lingua: Italiano
  Num. pagine: 132

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Parole chiave

biologia
bioinformatica
agraria
biologia molecolare
allineamento
ciclo cellulare
arabidopsis
filogenesi molecolare
alberi filogenetici molecolari
banche dati biologiche

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